Tiền thân của huyện là Mueang Phana Nikhon (พนานิคม) thuộc Mueang Ubon Ratchathani.Năm 1913 Huyện đã được đổi tên từ Pachin Ubon thành Trakan Phuet Phon.[1] Do trụ sở huyện nằm ở Ban Khulu, tên huyện đã được đổi tên thành Khulu. Năm 1939, tên được đổi tên thành Phana Nikhom,[2] được chuyển lại tên cũ vào năm sau.[3]